Op 3 mei 1997 overleed lodewijk op 83-jarige leeftijd, in Prangins in Zwitserland. Op 14 mei 1997 in de kerk Saint-Louis des Invalides, in aanwezigheid van talrijke burgerlijke en militaire persoonlijkheden, evenals vertegenwoordigers van de koninklijke, keizerlijke en republikeinse tradities. Onder de historische gewelven en de emblemen die zijn voorvader van de vijandelijke legers heeft overgenomen, worden zijn stoffelijke resten toevertrouwd aan de wacht van vier legionairs. De aanwezigheid van leden van geallieerde buitenlandse koninklijke families doet denken aan de prestigieuze allianties van het Huis van Bonaparte. Legergeneraal Maurice Schmitt, voormalig gouverneur van Les Invalides, hield een levendige lofrede en groette de man die “de eer had de naam Napoleon Bonaparte te dragen…”. Prins Napoleon rust vandaag uit in de crypte van de keizerlijke kapel in Ajaccio.