Zoals veel vrouwen van haar klasse sloot Augusta zich tijdens de Eerste Wereldoorlog aan bij het Rode Kruis en zette ze zich in voor de verzorging van de gewonden, die ze ook materieel ondersteunde met grote sommen geld. De aartshertogin wilde ook actieve dienst aan het front doen, maar haar grootvader, keizer Franz Joseph, maakte bezwaar. Ze startte de “Goud voor ijzer” -beweging, die welgestelde families aanmoedigde om hun sieraden te doneren om de opbrengst te gebruiken om de Oostenrijks-Hongaarse oorlogsinspanning financieel te ondersteunen. Ze was ook beschermvrouw van verschillende goede doelen. Ze richtte onder meer een ziekenhuis op in de wijk Kőbánya in Boedapest, dat na de oorlog werd omgebouwd tot een tehuis voor daklozen. Beide instellingen droegen haar naam. Tijdens de Sovjetrepubliek trok het paar zich terug in hun ouderlijk huis in Alcsút zonder politiek actief te worden.
Na de ineenstorting van de Sovjetrepubliek en de consolidering van de toestanden in Hongarije onder admiraal Horthy, behoorde het aartshertogpaar destijds tot de leidende sociale kringen in Hongarije. Het paleis van de aartshertog (voorheen Teleki -paleis) in de kasteelwijk Ofen Castle was destijds een centrum van de samenleving. Eind 1944, toen het Rode Leger al in Oost-Hongarije was, verliet Auguste von Bayern met haar gezin Hongarije. Het echtpaar verhuisde eerst naar de VS en later naar Duitsland , waar ze woonden bij de zus van de aartshertog, prinses Margarethe von Thurn und Taxis., woonde in Regensburg. De aartshertogin stierf daar op 25 juni 1964, twee jaar na haar man. Ze werd naast haar man begraven op de Feldafing- begraafplaats aan de Starnberger See.
De zomerresidentie Alcsút Castle werd het slachtoffer van de bommen van de Tweede Wereldoorlog en brandde eind 1944 volledig uit. Alleen de portiek en de voorgevel bleven over van het kasteel, dat vandaag samen met het park onder monumentenzorg staat. In het park werd een arboretum aangelegd, dat is ontstaan uit het park met zeldzame bomen en planten dat in 1825 door Palatine Joseph was aangelegd . Ook de kasteelkapel bleef behouden omdat deze los van het kasteel is gebouwd. Het familiearchief in Acsút brandde af. Het paleis van de aartshertog in Boedapest werd in 1968 zwaar beschadigd en opgeblazen. Nadat de communisten de macht hadden overgenomen in 1948 werd al het Habsburgse bezit in Hongarije genationaliseerd.
