Haar jeugd bracht zij door op het ouderlijk slot Possenhofen, niet ver van München. Zij was zeer gehecht aan haar iets oudere zus Marie met wie zij veel ondernam. Marie was in 1859 getrouwd met Frans II der Beide Siciliën.
Mathilde was net als haar zussen een knappe vrouw, maar zo dun en met een dusdanige piepstem dat ze door haar familie “Spatz” (mus) genoemd werd.