In haar laatste levensjaren werd Ludovika geconfronteerd met tragische gebeurtenissen:
- Op 13 juni 1886 werden de lichamen van Ludwig II van Beieren en die van zijn psychiater, dr. Bernhard von Gudden, in de Starnberger See ten zuiden van München, gevonden.
- Op 15 november 1888 overleed hertog Maximiliaan, Ludovika’s echtgenoot, aan een beroerte
- Op 30 januari 1889 pleegde haar kleinzoon, kroonprins Rudolf, zelfmoord in zijn jachtslot Mayerling
Op 25 januari 1892 ontving keizerin Elisabeth een telegram uit München: ‘Ludovika had een longontsteking’.
Op 26 januari 1892, om 04:00 uur in de ochtend, overleed hertogin Ludovika op 83-jarige leeftijd. Toen de hertogin overleed had ze zeven kinderen, vijftien kleinkinderen en twaalf achterkleinkinderen. Een dag na haar overlijden werd haar dertiende achterkleinkind geboren.