Keizerin Elisabeth hielp haar broer bij het regelen van zijn huwelijk. Hij was namelijk geïnteresseerd in prinses Amalie van Saksen-Coburg en Gotha. Leopold van Beieren was ook geïnteresseerd in prinses Amalie, maar Elisabeth regelde een huwelijk tussen Leopold en haar dochter Gisela. Het huwelijk tussen Maximiliaan Emanuel en Amalie werd in 1875 te Wenen voltrokken.
Maximiliaan Emanuel en Amalie kregen samen drie kinderen:
- Siegfried August
- Christoph Joseph
- Luitpold Emanuel
