Op 20 april 1903 trouwde Elisabeth Amelie met prins Alois von und zu Liechtenstein in Wenen. Keizer Franz Joseph I eiste echter als voorwaarde voor het huwelijk dat prins Alois zijn Oostenrijkse staatsburgerschap moest opgeven omdat Elisabeth Amelie niet de vrouw van een onderdaan mocht zijn.
Elisabeth Amelie en Alois kregen samen acht kinderen:
- Frans Jozef
- Marie Therese
- Karel Alfred
- George
- Ulrich
- Marie Henriëtte
- Alois
- Hendrik
Elisabeth Amelie was een enthousiaste jager en vergezelde haar man, die luitenant-kolonel was in de keizerlijke en koninklijke oorlog, door de garnizoenen totdat hij de heerschappij erfde in 1909 Groß Ullersdorf in Moravië nam het over.