Na de dood van zijn moeder in 1924 erfde hij de Kaiservilla in Bad Ischl. Vanaf 1934, toen het tijdperk van het austrofascisme begon, diende Hubert als districtsleider ( Gauführer ), een leidinggevende functie in het protectoraat.
Op 24 maart 1971 overleed de 77-jarige Hubert Salvator in Paleis Persenboeck in Persenboeck-Gottsdorf, Neder-Oostenrijk waar hij het grootste deel van zijn leven woonde, samen met acht andere leden van het Huis Habsburg. Hij werd begraven in het familiegraf van het kasteel.