In het jaar 1862 benoemde keizerin Sisi, Pauline en haar man, Alfred, tot hofmeester en hofmeesteres. Als gevolg hiervan stond het paar op de eerste plaats aan het hof van de keizerin.
De benoeming veroorzaakte enige opwinding aan het hof; enerzijds omdat Pauline niet behoorden tot de partij van de dominante keizerinmoeder, aartshertogin Sophie, die daarmee aan invloed verloor; aan de andere kant omdat gravin Pauline, in tegenstelling tot haar voorganger, gravin Esterhazy-Liechtenstein – door huwelijk maar niet door geboorte tot de (voorheen soevereine ) aristocratie behoorde , die absoluut domineerde aan het Weense hof, maar niettemin door haar nieuwe ambt alle dames aan het hof, waaronder hertoginnen, prinsessen en voormalige regerende gravinnen, gerangschikt, wat hen enorm irriteerde.
Pauline Königsegg werd onderscheiden met de Orde van het Sterrenkruis en werd in haar vroege jaren in Wenen beschouwd als de vertrouwelinge van de jonge keizerin. Ze kwam echter al snel op gespannen voet met de Hongaarse hofdames Ida Ferenczy en Marie Festetics , die de voorkeur gaven aan de keizerin en haar snel in haar voordeel opvolgden. Over het algemeen was ze tegen Sisi’s Hongaarse vrienden en verstond ze geen Hongaars