Nadat Mizzi Kaspar had geweigerd samen met hem te sterven, stelde de kroonprins Mary von Vetsera een zelfmoordpact voor. Hoewel hij waarschijnlijk gewoon niet alleen wilde sterven, zag Mary de plannen schijnbaar als de dramatische vereniging in de dood van door sterren gekruiste minnaars. Ze schreef:
“Als ik hem mijn leven zou kunnen geven, zou ik dat graag doen, want wat betekent het leven voor mij?”
In haar afscheidsbriefje aan haar zus schreef ze:
“We gaan allebei gelukzalig het onzekere verder in.”
In 1889 wisten veel mensen aan het keizerlijk hof, waaronder Rudolfs ouders en zijn vrouw Stefanie, dat Rudolf en Mary een affaire hadden. Zijn huwelijk met Stefanie was niet bepaald gelukkig en had geresulteerd in de geboorte van slechts één kind, een dochter genaamd Elisabeth, bekend als Erzsi. Rudolf had vanwege zijn seksuele affaires buiten het huwelijk zijn vrouw besmet met syfilis, waardoor ze geen kinderen meer kon krijgen.
Op 29 januari 1889 gaven Franz Joseph en Elisabeth een familiediner voordat ze op 31 januari naar Buda in Hongarije vertrokken. Rudolf verontschuldigde zich en reisde naar het jachthuis in Mayerling. Hij had een jacht geregeld in het Mayerling jachthuis, vroeg in de ochtend van de 30e. Toen zijn bediende, Johann Loschek, vroeg in de ochtend op zijn deur klopte om hem wakker te maken, kreeg hij geen antwoord. Rudolfs jachtgenoot, graaf Joseph von Hoyos-Stichstenstein voegde zich bij hem en ze probeerden de deur te openen.
Ten slotte sloeg Loschek met een hamer een deurpaneel in, zodat hij zijn hand erdoorheen kon steken om de deur van binnenuit te openen. Het was donker in de kamer. Ze vonden Rudolf zittend (volgens sommigen liggend) roerloos aan de rand van het bed, voorovergebogen en bloedend uit de mond. Voor hem op het nachtkastje stonden een glas en een spiegel. Zonder nader onderzoek in het slechte licht nam Loschek aan dat de kroonprins vergif uit het glas had gedronken omdat hij wist dat strychnine bloedingen veroorzaakte. Op het bed lag het lichaam van Mary Freiin von Vetsera; rigor mortis was al ingetreden. De verkeerde indruk dat er vergif in het spel was, en zelfs dat de barones de kroonprins had vergiftigd en vervolgens zelfmoord had gepleegd, zou enige tijd blijven bestaan.
Hoyos keek niet verder, maar haastte zich naar het station en nam een speciale trein naar Wenen. Hij haastte zich naar de adjudant-generaal van de keizer, paar, en verzocht hem het nieuws aan de keizer te vertellen. Het verstikkende protocol dat elke beweging in de Hofburg kenmerkte, beheerste het meldingsproces. Paar protesteerde dat alleen de keizerin dergelijk catastrofaal nieuws aan de keizer kon vertellen. Baron Nopcsa, controleur van het keizerinhuishouden, werd ontboden. Hij liet op zijn beurt Ida Ferenczy, de favoriete Hongaarse hofdame van keizerin Elisabeth, komen om te bepalen hoe Hare Keizerlijke Majesteit geïnformeerd moest worden.
Elisabeth was bij haar Griekse les en was ongeduldig door de onderbreking. Met witte lippen kondigde Ferenczy aan dat baron Nopcsa dringend nieuws had. Elisabeth antwoordde dat Nopcsa moet wachten en later terug moet komen. De gravin stond erop dat Nopcsa onmiddellijk zou worden ontvangen en voegde er ten slotte aan toe dat er ernstig nieuws was over de kroonprins. Dit verslag is afkomstig van Ferenczy zelf en aartshertogin Marie Valerie, aan wie Elisabeth haar herinnering aan het incident dicteerde, naast de beschrijving in haar dagboek.
Ferenczy kwam de kamer weer binnen en zag Elisabeth radeloos en onbedaarlijk huilen. De keizer verscheen buiten haar vertrekken en moest daar wachten met Nopcsa, die zich slechts met grote moeite kon beheersen. De keizerin vertelde het nieuws privé aan haar man.
De minister van politie werd ontboden en de nationale veiligheidsdiensten sloten het keizerlijke jachthuis en de omgeving af. Het lichaam van Mary von Vetsera werd zo snel mogelijk begraven, zonder gerechtelijk onderzoek en in het geheim. Haar moeder mocht haar begrafenis niet eens bijwonen.