Hoewel Ferdinand Karl Wenen niet meer in mocht kreeg hij nog één keer toestemming om Wenen in te komen om deel te nemen aan de begrafenisceremonie van zijn vermoorde broer, Franz Ferdinand en zijn vrouw Sophie. Maar op dat moment was Ferdinand Karl al getekend door de dood. Op 12 maart 1915 overleed Ferdinand Karl.
Zijn vrouw Berta overleefde hem met 64 jaar, ze stierf in het jaar 1979 op 99-jarige leeftijd. Ferdinand Karl en zijn vrouw Berta zijn zijn begraven in een gemeenschappelijke crypte in de Untermaiser Maria Trost-kerk in Meran.