Op 7 september 1879 werd er in Merano, Duitsland, een kind geboren.
Het was een jongen en zijn ouders noemde hem: Frans Jozef Gerardus Maria.
Frans Jozef was tweede zoon en het tweede kind van hertog Miguel II van Bragança en prinses Elisabeth von Thurn und Taxis.
Hij was de achterneef van keizerin Elisabeth.
Frans Jozef had één zus:
– Maria Teresa
Frans Jozef had één broer:
– Miquel
Frans Jozef had zeven halfzussen:
– Isabella
– Maria Benedicta
– Mafalda
– Maria Anna
– Maria Antonia
– Filipa
– Maria Adelheid
Frans Jozef had één halfbroer:
– Duarte Nuno
Frans Jozef werd vernoemd naar zijn peetoom, keizer Frans Jozef van Oostenrijk.
Frans Jozef volgde zijn vader op in het leger, hij kwam bij de huzaren, maar nadat hij zich daar ongedisciplineerd had gedragen, kreeg hij een standje van de Oostenrijkse keizer en werd vervolgens overgeplaatst naar de dragonders, waar hij belast werd met de grenspatrouille aan de Oostenrijks-Russische grens.
In augustus 1902 raakte Frans Jozef betrokken bij een zedenschandaal. In de marge van de kroning van de Britse koning Eduard VII, zou hij zich vergrepen hebben aan een vijftienjarige jongen. Bij dit schandaal zouden ook nog twee andere mannen betrokken zijn geweest. Een getuigen verklaarde door een gat in de slaapkamerdeur van een woonhuis in Lambeth gekeken te hebben en op die wijze zou hij de prins hebben gezien in seksueel verkeer met de jongen. Uit onderzoek in de betreffende woning bleek dat door het bewuste gat in de deur slechts enkele centimeters van het bed te zien waren geweest, deze getuige kon nooit de door hem beschreven handelingen hebben gezien. De prins werd hierop vrijgesproken, maar hij werd wel ontslagen uit het leger. Zijn bezittingen werden in een fonds, dat door zijn zwager, Karel Lodewijk von Thurn und Taxis, werd beheerd, ondergebracht.
Tijdens de Eerste Wereldoorlog trad hij opnieuw in dienst bij de Oostenrijkse huzaren. Frans Jozef werd krijgsgevangenen en vervoerd naar het Italiaanse eiland Ischia.
Op 15 juni 1919 overleed Frans Jozef in Ischia, hij overleed aan hartfalen.